Kolektivní orgán ustavený ředitelem odboru řízení programů, jehož cílem je vyhodnotit splnění podmínek veřejné soutěže a formálních náležitostí podaných návrhů projektů v souladu se zadávací dokumentací. Komise rozhoduje o vyhodnocení splnění podmínek a výsledný Protokol z hodnocení předkládá předsednictvu TA ČR k finálnímu rozhodnutí.