Kontrolní rada na svých zasedání kontroluje rozdělování finančních prostředků Technologické agentury, kontroluje hospodaření s majetkem státu, projednává stížnosti na postup Technologické agentury při hodnocení návrhů programových projektů, předkládá Informaci o činnosti KR na VVVKMT a Zprávu o činnosti KR Poslanecké sněmovně. Nedílnou součástí každého zasedání je schválení zápisu z minulého jednání. V rámci zasedání si může rada vyžádati doplňující informace ke stížnostem či nezávislý audit. Po skončení jednání dochází k realizaci přijatých rozhodnutí. Kontrolní rada předkládá svá stanoviska předsednictvu, která jsou pro předsednictvo závazná. Schválené zápisy jsou následně zveřejňovány online ve dvou variantách (veřejná a neveřejná).