Střednědobé hodnocení realizované evaluátorem v průběhu životního cyklu programu nejdříve po vyhlášení první veřejné soutěže a nejpozději rok před ukončením programu. Cílem je posoudit dosavadní průběh programu a jeho výsledky pro potřeby případných úprav nebo přípravy navazujícího programu. Schválená závěrečná zpráva předsednictvem TA ČR se předkládá pro informaci Výzkumné radě TA ČR a RVVI, přičemž konkrétní doporučení z evaluace jsou postoupena správci podnětů k dalšímu využití.