TA ČR zřizuje pokladnu v Kč a případně i v cizích měnách se souhlasem vedoucího ekonomického oddělení. Pokladník zodpovídá za to, aby zůstatek nepřesáhl stanovený limit, a v případě překročení vrací prostředky na účet. Pro doplnění pokladny žádá správce rozpočtu o výběr peněz z účtu TA ĆR. Finanční prostředky jsou zabezpečeny v trezoru a veškeré peněžní pohyby se provádějí na základě dokladů s podpisem. U výdajového pokladního dokladu pokladník vždy zkontroluje, zda k uvedenému výdaji existuje schválená objednávka nebo limitovaný příslib a zda byla provedena předběžná řídící kontrola.