Administrátor projektů v dostatečné době před stanoveným termínem zpřístupní elektronické aplikace pro podávání zpráv. Hlavní příjemce v ISTA vyplní Průběžnou zprávu (formulář F-059), případně Závěrečnou zprávu do ISTA (formulář F-196) a poté prostřednictvím datové schránky zasílá vygenerované Potvrzení elektronického podání zprávy do ISTA (formulář F-196).