Odborní hodnotitelů zpracovávají hodnocení podniku v obtíží v ISTA prostřednictvím formuláře Hodnocení podniku v obtížích (formulář F-261) do 10 dnů od přijetí objednávky. Ostatní hodnocení, tj. hodnocení specifických, úzce zaměřených kritérii dle požadavků veřejných soutěží probíhá mimo ISTA. Kopie jejich hodnocení je nicméně nahrána do ISTA do profilu daného hodnotitele.